Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LTBRP36941 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LTBRP36941 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LTBRP36941 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LTBRP36941 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LTBRP36941 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms