Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MCM5P33992 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MCM5P33992 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM5P33992 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM5P33992 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MCM5P33992 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM5P33992 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM5P33992 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM5P33992 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MCM5P33992 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms