Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
APOBEC3AP31941 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
APOBEC3AP31941 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms