Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC31.26■■■□□ 2.6
CLIP1P30622 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CLIP1P30622 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms