Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RXRBP28702 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RXRBP28702 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RXRBP28702 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RXRBP28702 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RXRBP28702 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RXRBP28702 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RXRBP28702 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RXRBP28702 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RXRBP28702 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RXRBP28702 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRBP28702 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRBP28702 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RXRBP28702 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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