Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLD1P28340 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLD1P28340 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLD1P28340 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLD1P28340 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLD1P28340 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLD1P28340 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms