Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SSFA2P28290 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SSFA2P28290 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms