Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PSMB5P28074 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PSMB5P28074 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms