Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IL3RAP26951 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms