Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN2P17655 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN2P17655 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms