Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HOXB4P17483 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms