Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DMDP11532 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
DMDP11532 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DMDP11532 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DMDP11532 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DMDP11532 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DMDP11532 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DMDP11532 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DMDP11532 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DMDP11532 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DMDP11532 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
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