Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KLK3P07288 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KLK3P07288 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
KLK3P07288 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLK3P07288 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLK3P07288 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms