Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC24BO95487 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC24BO95487 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms