Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CREB3O43889 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CREB3O43889 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CREB3O43889 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CREB3O43889 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CREB3O43889 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms