Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKAB2O43741 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms