Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SETD1AO15047 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SETD1AO15047 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms