Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIP1O00291 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIP1O00291 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIP1O00291 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIP1O00291 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HIP1O00291 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HIP1O00291 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms