Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ERVV-2B6SEH9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ERVV-2B6SEH9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms