Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVV-1B6SEH8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVV-1B6SEH8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms