Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0D9SFI3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms