Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 NDFIP2-206ENST00000620924 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP42P2-201ENST00000416089 2140 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC02150-201ENST00000513157 2120 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ARPP21-207ENST00000417925 3086 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SKA2-201ENST00000330137 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 C1orf21-201ENST00000235307 10265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 DENND2C-201ENST00000393274 6163 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL357552.2-201ENST00000433876 353 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR5G3-201ENST00000435756 929 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR7E62P-201ENST00000456741 477 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPS4XP19-201ENST00000460237 736 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC099328.2-201ENST00000465347 455 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL445P-201ENST00000495609 293 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR5M4P-201ENST00000529436 925 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC073571.1-201ENST00000549103 475 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 FXYD1-205ENST00000588607 619 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC129492.5-201ENST00000603489 315 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR6L2P-201ENST00000608207 925 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP005242.3-201ENST00000623604 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 GINS4-209ENST00000523277 3873 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CD28-201ENST00000324106 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHS1-202ENST00000361048 3249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC1-201ENST00000341068 8262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 BDNF-213ENST00000525950 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 FKTN-202ENST00000357998 2404 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC074198.1-201ENST00000506546 1397 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SELENOP-203ENST00000506577 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZNF812P-202ENST00000536819 1890 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 MBD3L1-201ENST00000305625 748 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP79-201ENST00000365193 109 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 SRSF7-202ENST00000409276 1050 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC007679.2-201ENST00000422116 781 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 RPS21P1-201ENST00000434479 247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 ARMC8P1-201ENST00000443069 1289 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL314P-201ENST00000490735 292 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC012613.1-202ENST00000512647 424 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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TRIM35Q9UPQ4 IGKV3D-31-201ENST00000519131 281 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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