Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
GDAP2Q9NXN4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
GDAP2Q9NXN4 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms