Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00572-201ENST00000450264 575 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL355076.1-201ENST00000484315 270 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC107220.1-201ENST00000514347 1037 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP003385.2-201ENST00000524910 973 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02322-201ENST00000554773 338 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC114546.2-201ENST00000560683 477 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC090287.1-201ENST00000578374 291 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR3689C-201ENST00000581239 72 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DSG1-AS1-204ENST00000581856 669 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02034-201ENST00000635368 760 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CCR3-208ENST00000545097 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ZKSCAN5-201ENST00000326775 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PDIK1L-201ENST00000374269 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PHLDB2-202ENST00000393925 5543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RGS2-201ENST00000235382 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM51EP-201ENST00000524374 1516 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 CD209-205ENST00000394161 507 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC133644.1-201ENST00000398171 937 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 EEF1GP6-201ENST00000402309 905 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 IGLC6-201ENST00000410078 317 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL121885.2-201ENST00000440255 819 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL021939.1-201ENST00000441868 886 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 GRM8-206ENST00000444921 1251 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RHEBP1-201ENST00000448647 556 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4422HG-201ENST00000451250 638 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC025180.1-201ENST00000505701 595 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC107959.3-202ENST00000523806 450 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DACT3-AS1-202ENST00000525008 496 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TIMMDC1Q9NPL8 DAZAP2-210ENST00000551313 587 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms