Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 STARD6-202ENST00000577499 696 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SGF29Q96ES7 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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