Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ZNF402P-201ENST00000404435 3100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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LRRC38Q5VT99 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
LRRC38Q5VT99 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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