Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 BPESC1-201ENST00000418282 3522 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 AC006511.3-201ENST00000624929 1783 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ARPP21-218ENST00000438071 1103 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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CCDC93Q567U6 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CCDC93Q567U6 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
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