Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC090181.3-201ENST00000624777 1514 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
IMPG1Q17R60 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms