Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNA5SP96-201ENST00000516041 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ARFGAP2-230ENST00000629231 213 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RMDN2-AS1-210ENST00000630021 1053 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SPIRE1-206ENST00000453447 2107 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 DEFB132-201ENST00000382376 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MKX-AS1-201ENST00000412244 745 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL356133.1-201ENST00000444762 372 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 LINC01839-201ENST00000451348 727 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 PGBD4P1-201ENST00000473644 407 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SL306P-201ENST00000492941 296 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC112206.2-201ENST00000503106 557 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 RN7SKP233-201ENST00000517005 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PDCD1Q15116 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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