Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LSM5-203ENST00000409782 649 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
RFTN1Q14699 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms