Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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TCIRG1Q13488 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
TCIRG1Q13488 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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