Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 RPS3AP15-201ENST00000483874 781 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NENFP1-201ENST00000419476 466 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
ITGB3BPQ13352 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms