Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL359091.1-201ENST00000449048 1734 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC103563.5-201ENST00000455643 364 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
CHAF1AQ13111 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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