Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPS29P62273 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPS29P62273 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPS29P62273 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RPS29P62273 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms