Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RN7SKP252-201ENST00000411210 327 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL121910.1-201ENST00000420710 500 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SNHG17-204ENST00000423536 517 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CRIP1P4-201ENST00000442565 229 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC003666.1-201ENST00000454113 611 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RN7SL484P-201ENST00000462651 202 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 UBC-213ENST00000546120 718 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AF038458.3-201ENST00000592518 500 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RBMS3-AS2-207ENST00000629416 456 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 REL-201ENST00000295025 11255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF197-202ENST00000344387 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MOGAT2-203ENST00000526712 3204 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ARHGAP11A-202ENST00000543522 3152 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SCMH1-202ENST00000337495 3108 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SYNE1-204ENST00000367248 7165 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SPATA13-204ENST00000399949 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 WBP11P1-202ENST00000567636 2972 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 OTOF-205ENST00000403946 6937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC002101.1-201ENST00000564021 1990 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 DAPK1-219ENST00000622514 5772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC046168.1-201ENST00000561283 3814 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 BRF1-204ENST00000392557 3579 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 AC020904.2-201ENST00000621646 1669 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 HSP90AB1-203ENST00000371646 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NOL6-204ENST00000379471 3843 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AL773572.1-202ENST00000440221 1004 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 RPSAP54-201ENST00000454001 886 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 BX072579.2-201ENST00000455857 525 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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HOXD11P31277 TEP1-209ENST00000556935 7643 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC025283.2-203ENST00000618352 2905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC011365.1-201ENST00000522615 3478 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 FNIP2-201ENST00000264433 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 PSG9-204ENST00000418820 1748 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 MRS2-201ENST00000274747 3821 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 METTL2B-201ENST00000262432 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 NEUROD6-201ENST00000297142 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C17orf47-201ENST00000321691 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SLC22A6-201ENST00000360421 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 GAB4-201ENST00000400588 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 DAPK1-209ENST00000472284 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 LOXHD1-207ENST00000441551 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 SYT2-201ENST00000367267 7614 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 C11orf54-201ENST00000331239 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TBC1D22A-AS1-202ENST00000640274 1951 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 TMEM255A-203ENST00000371369 3425 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 VARS2-213ENST00000625423 3362 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
HOXD11P31277 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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