Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 MAT1A-201ENST00000372213 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC12A8-201ENST00000393469 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 CTAGE9-201ENST00000314099 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 OSBPL1A-202ENST00000357041 1869 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC30A8-208ENST00000521243 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
TRHP20396 CHRNA6-201ENST00000276410 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC4A9-205ENST00000507527 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 COL21A1-201ENST00000244728 4339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 NRXN3-202ENST00000335750 2764 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 GTF2IP1-202ENST00000614592 2047 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ADA2-202ENST00000330232 3195 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ZNF701-201ENST00000301093 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC100843.1-201ENST00000475372 550 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC024337.1-201ENST00000558860 1562 ntTSL 4 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 PPM1L-202ENST00000464260 2735 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 IFT122-203ENST00000348417 3877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AL138690.1-201ENST00000568811 2243 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 DSG3-201ENST00000257189 5525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 NR4A2-201ENST00000339562 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 CHURC1-206ENST00000552002 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ELF4-204ENST00000615377 3878 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC073324.1-201ENST00000425993 1435 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 MAN1A2P1-201ENST00000590286 1400 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 OR7E122P-202ENST00000641144 6171 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 ACAD10-201ENST00000313698 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
TRHP20396 DDX19B-201ENST00000288071 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 NBPF9-202ENST00000584027 5034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 RAPGEFL1-201ENST00000264644 3429 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 GNL3L-202ENST00000360845 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 FUT10-201ENST00000327671 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 HEATR6-203ENST00000585976 3288 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 HEATR6-212ENST00000613428 3287 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
TRHP20396 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 DNAH9-203ENST00000454412 13452 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 NFRKB-202ENST00000524746 4114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 DZIP1-201ENST00000347108 7068 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 TRAV5-201ENST00000390427 352 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 OR2M3-201ENST00000456743 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
TRHP20396 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms