Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SNW1-205ENST00000555761 1855 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HDAC6Q9UBN7 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HDAC6Q9UBN7 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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HDAC6Q9UBN7 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC013549.1-201ENST00000454086 566 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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HDAC6Q9UBN7 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HDAC6Q9UBN7 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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