Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LCN1P2-201ENST00000372030 223 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 NR1I3-208ENST00000412844 989 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL121823.1-201ENST00000418369 741 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 TMEM106C-215ENST00000550552 776 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
EHD3Q9NZN3 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6□□□□□ -1.45
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