Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
ZNF548Q8NEK5 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZNF548Q8NEK5 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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