Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AL031123.3-201ENST00000623345 1837 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NUDT13-206ENST00000537969 2151 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC089998.1-201ENST00000548575 3141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
SYNE4Q8N205 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AP001636.3-201ENST00000533954 2810 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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SYNE4Q8N205 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
SYNE4Q8N205 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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