Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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RTL8BQ17RB0 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
RTL8BQ17RB0 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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