Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC078785.2-201ENST00000462010 1253 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC024601.1-201ENST00000427247 524 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MEF2C-AS1-211ENST00000514092 501 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP001000.1-201ENST00000526843 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAM2Q15035 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms