Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC007731.1-202ENST00000610338 1870 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 FAM204BP-201ENST00000369171 701 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 C1D-203ENST00000409302 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01762-205ENST00000437308 539 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PCMTD1P3-201ENST00000451824 472 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ZNF286A-205ENST00000472486 827 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL136018.1-202ENST00000555300 488 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RN7SL778P-201ENST00000607160 297 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC108861.1-201ENST00000611634 585 ntTSL 4 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MIR6736-201ENST00000616799 59 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC01232-205ENST00000630421 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ABCB5-205ENST00000443026 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SLC16A4-202ENST00000369781 2082 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 GOLGA6L6-201ENST00000619213 4013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MAP3K7CL-203ENST00000341618 1855 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC091304.1-202ENST00000568624 3100 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CARD8-217ENST00000520753 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 SLC35A3-201ENST00000370153 5708 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 EIF4E2-207ENST00000409514 3525 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ZFP2-202ENST00000520301 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TPPP2-201ENST00000321760 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 CSN2-201ENST00000353151 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 TMEM126B-202ENST00000393375 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 VDAC2P3-201ENST00000430995 828 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC079781.1-201ENST00000441505 394 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PMS2P11-201ENST00000451831 574 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC00533-201ENST00000456103 537 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC002368.1-201ENST00000456981 388 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPL23P10-201ENST00000468780 412 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC019209.3-201ENST00000536949 772 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 PRB1-203ENST00000545626 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC013283.1-201ENST00000557282 492 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC099314.1-201ENST00000563916 562 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
NCOA4Q13772 AC006116.6-201ENST00000593258 1103 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms