Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 GPRIN3-202ENST00000609438 14244 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL161756.1-201ENST00000555861 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ARL6-204ENST00000463745 4231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 UQCRB-209ENST00000523920 695 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KCNMA1-203ENST00000354353 5732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL512634.1-201ENST00000566873 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTCH1Q13635 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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