Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC108066.1-201ENST00000437261 596 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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CUL3Q13618 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL3Q13618 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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