Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AL390726.6-201ENST00000637760 1654 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
CUL1Q13616 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL358074.1-201ENST00000444800 509 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC027117.1-201ENST00000520646 667 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NPIPA8-202ENST00000541810 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NPIPA3-203ENST00000552140 1053 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 NPIPA2-203ENST00000553201 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CUL1Q13616 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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