Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC073333.2-201ENST00000603589 769 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
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SEMA3BQ13214 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
SEMA3BQ13214 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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