Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC011369.2-201ENST00000624423 1567 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC005674.2-201ENST00000561486 3510 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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