Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
FAM3AP98173 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RNU1-65P-201ENST00000363919 148 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
FAM3AP98173 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.4 ms