Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC097641.3-201ENST00000613523 464 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RANBP3L-204ENST00000515759 1532 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 METTL5-202ENST00000308099 629 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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